A monokuláris mikroszkóp nagyított tárgyak megfigyelésére szolgáló optikai eszköz, amelyre jellemző, hogy csak egy szemlencséje (okulárja) van, így a megfigyelő egy szemmel néz bele. Ez a kialakítás azt eredményezi, hogy a kapott kép kétdimenziósnak, azaz laposnak érzékelhető, térbeli mélység nélkül. Egyszerűbb felépítésének és az ezzel járó alacsonyabb árnak köszönhetően gyakran használják az oktatásban, illetve kezdő vagy hobbi megfigyelők számára. Elsősorban vékony és áttetsző preparátumok, például sejtek vagy tárgylemezen lévő szövetmetszetek vizsgálatára alkalmas. Hosszabb munka során az egyszemes megfigyelés megterhelőbb lehet a felhasználó látása számára, és gyorsabb fáradáshoz vezethet.
